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La composition du microbiome intestinal peut être liée à un risque de COVID à long terme

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La composition du microbiome intestinal peut être liée au risque d’une personne de développer un « long COVID » plusieurs mois après l’infection initiale par le SRAS-CoV-2, le virus responsable de l’infection au COVID-19, suggère une recherche publiée en ligne dans la revue Intestin.

Le «profilage» du microbiome pourrait aider à identifier ceux qui sont les plus susceptibles de développer la maladie, suggèrent les chercheurs.

Le syndrome COVID-19 post-aigu, surnommé « COVID long », se caractérise par des complications et/ou des symptômes persistants des semaines et des mois après l’infection initiale par le COVID-19.

Il est relativement courant, jusqu’à 3 personnes sur 4 signalant au moins un symptôme 6 mois après la guérison de l’infection au COVID-19. La fatigue, la faiblesse musculaire et l’insomnie sont les symptômes les plus fréquemment signalés.

Une réponse exagérée du système immunitaire, des dommages cellulaires ou les conséquences physiologiques d’une maladie grave peuvent contribuer au développement d’un long COVID. Mais on ne sait pas exactement ce qui le cause, ou pourquoi certaines personnes semblent être plus sensibles, disent les chercheurs.

Un nombre croissant de preuves a impliqué le microbiome intestinal – les billions de bactéries, de champignons et d’autres microbes qui habitent le tube digestif – dans la gravité du COVID-19.

Et étant donné que l’intestin joue un rôle majeur dans l’immunité, une réponse immunitaire désordonnée à l’infection au COVID-19, induite par des microbes résidents, peut également affecter le processus de récupération.

Les chercheurs ont donc voulu savoir si la composition du microbiome intestinal pouvait être liée à un long COVID, défini comme au moins un symptôme persistant 4 semaines après l’élimination du SRAS-CoV-2 du corps.

Ils ont suivi les changements dans le microbiome intestinal de 106 patients présentant divers degrés de gravité du COVID-19, traités dans 3 hôpitaux différents entre février et août 2020, et dans un groupe de comparaison de 68 personnes qui n’avaient pas le COVID-19, au cours de la même période. point final.

Ils l’ont fait en analysant les échantillons de selles des participants. Parmi les 106 patients atteints de COVID-19, des échantillons de selles ont été prélevés à l’admission (68), puis à nouveau après 1 mois (64) et après 6 mois (68). Des échantillons de selles ont également été prélevés chez 11 patients 9 mois plus tard.

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Les chercheurs ont vérifié la présence des 30 symptômes COVID longs les plus fréquemment signalés 3 et 6 mois après l’infection initiale au COVID-19. La capacité aérobie et l’endurance, un indicateur de COVID long, ont également été mesurées lors d’un test de marche à distance de 6 minutes.

L’âge moyen des patients infectés par le COVID-19 était de 48 ans ; un peu plus de la moitié étaient des femmes. La plupart (81 %) avaient une infection légère à modérément grave ; 25 ont été traités avec des antibiotiques.

Une COVID longue a été rapportée chez 86 (81%) de ces patients à 3 mois et chez 81 (76,5%) à 6 mois. Les symptômes les plus fréquents à 6 mois étaient la fatigue (31 %), les troubles de la mémoire (28 %), la chute des cheveux (22 %), l’anxiété (21 %) et les troubles du sommeil (21 %).

Il n’y avait aucune différence significative dans les facteurs potentiellement influents, tels que l’âge, le sexe, la prévalence des conditions sous-jacentes, l’utilisation d’antibiotiques ou de médicaments antiviraux, ou la gravité du COVID-19 entre les patients avec et sans COVID long, 6 mois après l’infection initiale.

Parmi les 68 patients atteints de COVID-19 dont les échantillons de selles ont été analysés à 6 mois, 50 avaient un long COVID.

Alors que la charge virale initiale n’était pas associée à un long COVID, leur microbiome intestinal différait de celui des patients sans long COVID et de ceux qui n’avaient pas eu d’infection au COVID-19.

Ces patients avaient un microbiome moins diversifié et moins abondant ; le microbiome intestinal des patients qui n’ont pas développé de long COVID était similaire à celui de ceux qui n’avaient pas eu de COVID-19.

Parmi les espèces de bactéries trouvées chez les patients atteints de COVID long, 28 ont été réduites et 14 ont été enrichies à la fois à l’admission à l’hôpital et à 3 et 6 mois après la sortie de l’hôpital.

À 6 mois, les patients atteints de long COVID avaient significativement moins de « amicaux » F. prausnitzii, et Blautia obeum et une plus grande abondance de « inamicaux » Ruminococcus gnavus et Bacteroides vulgatus que les personnes qui n’avaient pas eu le COVID-19.

D’autre part, le microbiome intestinal de ceux qui n’ont pas développé de long COVID n’a montré que 25 changements d’espèces bactériennes à l’admission à l’hôpital, et cela s’est complètement rétabli après 6 mois.

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Les chercheurs ont ensuite examiné la composition du microbiome intestinal pour voir s’il était associé à différentes catégories de symptômes COVID longs : respiratoires ; neuropsychiatrique (maux de tête, étourdissements, perte de goût et d’odorat, anxiété, manque de concentration, sommeil perturbé, mauvaise humeur, mauvaise mémoire, vision floue); gastro-intestinal; peau (perte de cheveux); musculo-squelettique; et fatigue.

Quatre-vingt-une espèces bactériennes étaient associées à différentes catégories de COVID longs et de nombreuses espèces étaient associées à plus de deux catégories de symptômes persistants.

Par exemple, à 6 mois, les symptômes respiratoires persistants étaient fortement associés à plusieurs microbes opportunistes « inamicaux », dont Streptocoque angineux, Streptocoque vestibulaire, Streptococcus gordonii et Clostridium dispricum.

Et plusieurs espèces connues pour renforcer l’immunité, notamment Bifidobacterium pseudocatenulatum, F. prausnitzii, R. inulinivorans et Roseburia hominis, ont été épuisés chez les personnes atteintes de COVID long à 6 mois.

De même, plusieurs espèces de bactéries «inamicales» ont été associées à de moins bonnes performances au test de marche de 6 minutes chez les personnes atteintes de COVID long.

Lors de l’admission à l’hôpital, la diversité et la richesse des bactéries intestinales chez les patients qui ont ensuite développé un long COVID étaient significativement inférieures à celles des patients qui ne l’ont pas fait, ce qui suggère que des profils microbiens intestinaux particuliers peuvent indiquer une sensibilité accrue, selon les chercheurs.

Il s’agit d’une étude d’observation, et en tant que telle ne peut pas établir la cause. Et seul un petit nombre de participants ont été inclus dans l’étude. Mais les résultats font écho à ceux d’autres recherches, impliquant un microbiome intestinal désordonné dans une gamme de conditions à long terme, soulignent les chercheurs.

Et ils concluent : « En résumé, la composition modifiée du microbiome intestinal est fortement associée à des symptômes persistants chez les patients atteints de COVID-19 jusqu’à 6 mois après l’élimination du virus SARS-CoV-2.

« Compte tenu des millions de personnes infectées pendant la pandémie en cours, nos découvertes sont une forte impulsion pour envisager la modulation du microbiote afin de faciliter la récupération rapide et de réduire le fardeau du syndrome post-aigu COVID-19.


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