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Le manque de changements de gants dans les centres de test COVID-19 a entraîné une contamination croisée majeure des échantillons

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Le manque de changements de gants dans les centres de test COVID-19 en Belgique a entraîné une contamination croisée majeure des échantillons et un taux élevé de résultats faussement positifs, la recherche étant présentée cette année au Congrès européen de microbiologie clinique et des maladies infectieuses (ECCMID) à Lisbonne, Portugal , (23-26 avril) a trouvé.

L’introduction des tests PCR à grande échelle pour le COVID-19 a présenté un certain nombre de défis logistiques, notamment une pénurie de personnel correctement formé pour effectuer un prélèvement nasopharyngé.

Les recherches d’un laboratoire financé par le gouvernement en Belgique ont identifié une gestion inadéquate des EPI dans les centres de test comme une source de contamination croisée majeure.

Les scientifiques de la Plateforme fédérale COVID-19, Département de médecine de laboratoire UZ Leuven, Louvain, Belgique ont été alertés du problème en septembre 2021 lorsqu’ils ont remarqué que 70 % des échantillons prélevés ce jour-là dans un centre de test du Brabant flamand, en Flandre, avaient été testés positif pour COVID-19. Le taux de positivité moyen à l’époque était d’environ 5 à 10 %.

90% des échantillons positifs avaient une charge virale très faible, ce qui laissait entendre qu’ils avaient été contaminés par le virus SARS-CoV-2, plutôt que d’être de vrais positifs.

Les résultats des patients ont été immédiatement retenus et une analyse des causes profondes (une enquête sur la cause du pic dans les échantillons positifs) a été effectuée.

Le chercheur principal Bram Slechten déclare : « Après avoir exclu la contamination du laboratoire, nous avons classé les résultats de ce jour par ordre chronologique en fonction de l’heure du prélèvement de l’échantillon.

« Nous avons vu que personne n’avait été testé négatif après qu’un échantillon ait été prélevé sur un patient avec une charge virale très élevée et avons immédiatement contacté le centre de test.

« Cela a conduit à un manque de changement de gants, en combinaison avec une collecte d’échantillons à un rythme élevé par un nouvel écouvillon et la rupture d’un écouvillon dans le tube, identifié comme la source probable de la contamination.

« Les protocoles de ce centre de test ont été affinés du jour au lendemain et tous les patients dont les résultats ont été retenus ont été rappelés pour un nouvel échantillon le lendemain. 100 % d’entre eux étaient négatifs. »

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Pour évaluer l’ampleur du problème, M. Slechten et ses collègues ont ensuite vérifié rétrospectivement quatre mois de résultats (juin-septembre 2021) de tests PCR de 11 centres de test pour les faux positifs.

Une série suspectée d’échantillons contaminés a été définie comme un minimum de trois échantillons faiblement positifs (faible charge virale, 4 copies d’ARN/mL) après un échantillon positif avec une charge virale élevée (>106 copies ARN/mL).

Ils ont également visité les sites pour évaluer le personnel.

L’analyse a identifié des événements potentiels de contamination croisée dans 73 % (8/11) des centres de test. Le pourcentage d’échantillons suspectés d’être signalés à tort comme positifs variait largement par jour et par centre. La moyenne sur quatre mois variait de 0% à 3,4% par centre de test.

Le plus grand nombre de faux positifs dans un centre de test en une seule journée était de 77 (sur 382 tests) – 20% des personnes testées ce jour-là. (Tous ces patients ont eu la possibilité de refaire le test.)

Les visites sur place ont permis d’identifier que le manque de changement de gants entre les patients est la source de contamination croisée.

« Si le personnel ne changeait pas de gants entre chaque patient, il était presque certain qu’une contamination se produirait », explique M. Slechten. « Nous avons identifié quatre raisons pour lesquelles le changement de gants n’a pas eu lieu : ce n’était tout simplement pas dans le protocole ; le protocole correct était en place mais il n’a pas été suivi en raison du manque de formation des nouveaux membres du personnel ; ne pas avoir la bonne taille de gant disponible ; pression de travail, certains écouvillons devaient prélever un patient toutes les deux minutes. »

Des politiques d’EPI plus rigoureuses ont été mises en place dans les 11 centres de test à partir de fin octobre 2021, en réponse aux résultats de l’étude.

Cela comprenait les responsables chargés d’informer chaque membre du personnel qui prélevait des patients de l’importance du changement de gants et des centres de test contactés en cas de pic de leur taux de faux positifs.

Le suivi d’un centre de test a révélé l’impact. Avant l’intervention, il avait un taux de positivité quotidien de 11 % et un taux moyen de fausses positivités de 3,4 %. Mais occasionnellement, le taux de faux positifs atteignait 20 %. Après l’intervention, le taux de faux positifs est tombé à presque zéro.

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L’équipe de l’UZ-Leuven continue de surveiller les taux de faux positifs, afin de détecter tout événement isolé de contamination croisée.

De plus, Sciensano (l’institut scientifique belge de santé publique) a alerté tous les laboratoires belges sur le problème en octobre 2021.

Les chercheurs affirment que la plupart des cas de contamination croisée ont été détectés à temps pour retenir les résultats et rappeler les patients, ce qui signifie que les résultats erronés n’ont pas été communiqués. Certains cas, cependant, n’ont pas été détectés, ce qui signifie que certains jours, de nombreux patients ont reçu un mauvais résultat.

M. Slechten déclare : « Le prélèvement nasopharyngé implique un contact étroit entre la main du professionnel de santé, le patient et le tube de prélèvement. Il est donc essentiel de changer de gants entre chaque patient.

« Dans le cadre d’un échantillonnage à haut débit, un personnel insuffisamment formé a dû échantillonner un grand nombre de patients dans un temps limité. Cette situation a entraîné un niveau élevé de contamination croisée qui était passé largement inaperçu, entraînant des faux positifs et l’auto-infection des personnes. s’isoler et s’absenter du travail inutilement.

« De plus, chaque faux positif génère des contacts à haut risque qui peuvent également avoir besoin d’être testés, ce qui augmente le fardeau pour les laboratoires, les centres de test et la recherche des contacts. »

Il pense que les faux positifs ont artificiellement gonflé le nombre de cas de COVID-19 pour la Belgique. Il déclare : « Il est cependant difficile de chiffrer, car nous avons constaté de nombreuses différences entre les centres de test que nous avons étudiés. De plus, nous n’avons examiné que les centres de test dans une partie de la Belgique, ce qui rend difficile l’obtention du image entière.

« Il est très probable que cela se soit également produit dans d’autres pays.

« Bien que je n’aie pas une connaissance détaillée des protocoles dans les centres de test d’autres pays, l’accent est généralement mis sur les événements potentiels dans l’environnement du laboratoire. Cependant, notre recherche fournit un exemple parfait de l’importance de regarder au-delà du laboratoire et de garder un un œil sur toute la chaîne de test. »


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