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Une étude préliminaire révèle que des légumes biologiques sont contaminés par un large éventail de microbes pathogènes

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De nouvelles recherches qui seront présentées cette année au Congrès européen de microbiologie clinique et des maladies infectieuses (ECCMID) à Lisbonne, Portugal (23-26 avril), suggèrent que les amibes pathogènes qui vivent sur des légumes à feuilles biologiques peuvent abriter des agents pathogènes humains comme Pseudomonas, Salmonelle, et Helicobacter et représentent un risque potentiel pour la santé publique. L’étude est menée par le Dr Yolanda Moreno et ses collègues de l’Universitat Politècnica de València en Espagne.

Les maladies d’origine alimentaire résultant de la consommation de produits frais contaminés sont courantes et peuvent avoir de graves effets sur la santé humaine, en particulier lorsqu’elles sont consommées crues. Il y a une demande croissante de fruits et légumes issus de l’agriculture biologique alors que les gens s’efforcent de manger sainement et au milieu des inquiétudes concernant la contamination potentielle par les pesticides, les engrais chimiques et les herbicides. Cependant, pendant la croissance, la récolte, le transport et la transformation et la manipulation ultérieures, les produits frais peuvent être contaminés par des agents pathogènes d’origine humaine ou animale, par contact avec le sol, l’eau d’irrigation, l’air, la pluie, les insectes et lors du lavage industriel des produits.

Les légumes peuvent être contaminés par certains protozoaires (organismes unicellulaires) tels que les amibes libres (FLA), qui se nourrissent de bactéries et peuvent servir d’hôtes à des bactéries pathogènes (appelées « chevaux de Troie ») qui résistent à la digestion des FLA et pourrait constituer une menace pour la santé publique.

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« Les environnements alimentaires et liés à l’alimentation créent un lieu de rencontre idéal pour les amibes libres et les bactéries pathogènes », explique le Dr Moreno. « Cependant, on sait relativement peu de choses sur la présence et la diversité des amibes libres sur les légumes biologiques et leur rôle dans la transmission des agents pathogènes humains. »

Pour mener une étude préliminaire du microbiome FLA isolé à partir de légumes biologiques, les chercheurs ont collecté 17 échantillons de laitue et d’épinards dans les supermarchés locaux de Valence entre novembre 2020 et mai 2021.

Pour étudier le degré de contamination, les chercheurs ont utilisé une technique métagénomique qui identifie l’ADN dans toutes les bactéries présentes à l’intérieur de la FLA. Les résultats ont été évalués pour déterminer quels types de microbes (microbiome) se trouvaient dans chaque échantillon.

Les principaux types bactériens identifiés étaient Flavobacterium (présent dans 10 % des échantillons de légumes) et Pseudomonas (10 %), dont beaucoup ne provoquent pas de maladie chez l’homme. Cependant, un tiers des échantillons (34 %) contenaient 52 types de bactéries potentiellement pathogènes, dont Légionelle, Salmonelleet Arcobactérie. Les infections qui en résultent peuvent provoquer des maladies, notamment des pneumonies et des maladies gastro-intestinales.

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De plus, l’espèce FLA Vermamoeba vermiformis qui provoque couramment des infections graves chez l’homme a été trouvé dans un cinquième (19 %) des échantillons de légumes ; et Acanthamoeba castellaniiqui peuvent causer la cécité et l’encéphalite ont été identifiés dans près des deux tiers (63 %) des échantillons.

« La présence de bactéries préoccupantes pour la santé publique contenues à l’intérieur des amibes libres suggère qu’il s’agit de véhicules qui peuvent facilement transmettre des agents pathogènes capables d’atteindre l’homme et de causer des problèmes de santé par le biais de légumes biologiques contaminés », explique le Dr Moreno. « La contamination peut résulter du traitement du sol avec des engrais organiques tels que le fumier et les boues d’épuration et de l’eau d’irrigation. Les légumes-feuilles sont particulièrement sensibles à la contamination fécale en raison de leur proximité avec le sol et de la probabilité que les humains les consomment sans cuisson. Notre les résultats soulignent également la nécessité d’éduquer le public sur la manipulation sûre et appropriée des légumes biologiques frais avant de les manger frais ou légèrement cuits. »

Malgré les découvertes importantes, les auteurs notent que l’étude ne comprenait qu’un petit échantillon de légumes biologiques feuillus d’une ville d’Espagne, et des études plus importantes sont nécessaires dans différents pays pour mieux comprendre la qualité microbiologique et la sécurité des légumes biologiques.


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